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第一章 绪论1

一、治疗人类疾病的抗生素4

二、抗生素的新应用11

三、其他酶化合物15

四、药用真菌毒素16

五、组合生物合成16

六、结语17

参考文献20

第二章 微生物资源33

第一节 陆地微生物资源33

一、陆地微生物资源在抗生素开发方面的应用34

二、陆地微生物资源在非抗生素药物开发方面的应用35

三、陆地微生物资源开发前景36

第二节 海洋微生物资源37

一、海洋放线菌37

二、海洋真菌资源43

三、海洋真菌产生的生物活性物质44

第三节 雨林内生微生物资源61

一、新药研发的需求62

二、内生微生物63

三、内生微生物宿主选择64

四、内生微生物及生物多样性65

五、内生微生物次生代谢产物66

六、内生微生物的采集、分离及保存67

七、内生微生物的天然产物67

八、小孢拟盘多毛孢菌的分子生物学研究结果76

九、结语77

参考文献78

第三章 微生物来源的药物89

第一节 抗细菌药物89

一、β-内酰胺类89

二、氨基糖苷类：链霉素89

三、大环内酯类：红霉素90

四、糖脂肽类：万古霉素91

五、脂肽类：达托霉素92

六、安莎类：利福霉素92

七、其他：莫匹罗星94

第二节 抗真菌药物94

一、真菌药物作用靶点94

二、多烯类94

三、棘白菌素类96

第三节 抗癌药物97

一、埃博霉素97

二、romidepsin100

三、dibenzodiazepine101

第四节 其他活性物质102

一、霉酚酸酯102

二、咪唑立宾102

三、他克莫司103

参考文献103

第四章 构建高质量的微生物天然产物库106

第一节 构建高质量的菌种资源库107

一、利用多元化的培养方法和体系扩大可培养微生物的多样性107

二、微生物菌种去重复化109

三、通过环境宏基因组文库构建扩大基因资源多样性111

四、展望114

第二节 构建高质量微生物提取物和化合物库114

一、扩大微生物次级代谢产物多样性及去重复化115

二、高效液相色谱方法监控提取物质量117

三、去重复化化合物分离和结构鉴定121

四、微生物天然产物的多样性和结构复杂性125

五、对新基因的预测（鉴别新的PKS和NRPS基因）126

六、展望127

参考文献128

第五章 微生物次生代谢产物高通量筛选137

第一节 高通量筛选技术的发展趋势和国内外现状138

一、高通量筛选技术的发展历史及发展趋势138

二、高通量筛选技术的国内外现状及存在问题139

三、微生物高通量筛选的特色141

第二节 微生物高通量筛选系统142

一、微生物的高通量培养和样品制备体系142

二、自动化高通量样品处理体系147

三、微生物高通量筛选模型149

第三节 互动抗真菌药物筛选151

一、真菌感染性疾病概述151

二、抗真菌药物现状和挑战153

参考文献165

第六章 微生物天然药物研究策略178

第一节 微生物中发现新药的整合方法178

一、从多种生境系统中选择采集样品180

二、调控微生物生理途径刺激微生物代谢产物多样化184

三、基因改造构建人工天然产物187

四、微生物菌种和代谢产物去重复化分析189

五、结语193

第二节 全自动高效液相色谱法分析微生物提取物194

一、高效液相色谱方法195

二、小样发酵产物的预筛选196

三、最佳发酵条件选择196

四、化学分析197

五、高效液相色谱数据分析软件197

六、高效液相色谱数据分析软件的应用198

第三节 基因调控用于微生物新药发现204

一、大环内酯类抗生素208

二、通过基因工程合成格尔德霉素类似物211

三、海洋微生物宏基因组来源的聚酮基因213

四、基因工程生产药物发展方向214

第四节 基于宏基因组学的天然产物研究214

一、包含微生物多样性的环境DNA文库的构建217

二、新型链霉菌属和假单胞菌属宿主表达品系219

三、重组pMBD14质粒的转移和表达221

四、筛选重组子库223

五、构建用于高通量筛选的高质量的环境文库227

六、结语229

第五节 微生物菌种基因工程改造技术230

一、进化工程和DNA改组233

二、基因改组和酶进化237

三、基因组改组和生物进化240

四、基于演化关系的电子预筛选243

五、结语245

第六节 合成生物学的适配性研究245

一、引言245

二、国内外研究现状和发展趋势249

参考文献254