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第1章 基因组学1

1.1基因组学的定义1

1.2基因组学的分类1

1.3基因组学研究现状2

1.4研究功能基因组学的挑战5

1.5我国基因组学研究进展7

第2章 生态与环境基因组学8

2.1生态与环境基因组学的含义8

2.2生态与环境基因组学的研究对象8

2.3生态与环境基因组学研究的主要项目10

2.4生态与环境基因组学研究的意义11

第3章 模式生物基因组学13

3.1模式生物的定义13

3.2模式生物基因组研究进展13

3.3模式生物的基因工程14

第4章 水体基因组学——海洋环境生态基因组学26

4.1水体的概念26

4.2水体污染治理方法与现状26

4.3宏基因组学研究方法进展27

第5章 土壤基因组学33

5.1土壤宏基因组文库33

5.2土壤宏基因组文库的筛选技术35

5.3宏基因组测序及数据分析36

5.4基于宏基因组的微生物生态学与环境学分析38

5.5宏基因组学在土壤微生物生态学中的应用与展望40

第6章 环境中的病原微生物基因组学43

6.1通过基因组测序和功能注释研究细菌致病机理43

6.2利用比较基因组学研究细菌致病性47

第7章 生态与环境基因组学研究方法55

7.1基因芯片55

7.2 DNA微阵列的原理与应用60

7.3荧光原位杂交技术71

7.4基因差异表达研究技术81

第8章 生态环境中的微生物群落功能基因与表达分析91

8.1环境微生物群落功能基因与定位91

8.2环境微生物群落功能基因表达分析102

第9章 生态环境中的抗逆、抗病基因132

9.1植物在生态环境中的抗逆机制132

9.2生态环境中的植物抗逆基因工程研究进展133

9.3植物抗逆相关基因的分离135

9.4植物在生态环境中的抗病研究140

9.5植物抗病基因工程的原理142

第10章 生态环境中的毒理基因组学145

10.1生态环境中毒理基因组学的产生145

10.2毒理基因组学的特点146

10.3生态与环境中的毒理基因组学技术支持147

10.4毒理基因组学的生物平台148

10.5毒理基因组学的应用149

10.6毒理基因组学在生态风险评价方面的应用150

10.7毒理基因组学目前尚待解决的问题151

10.8 MicroRNA毒理基因组学的优势和挑战154

10.9结论与展望155

第11章 基因组学在生态环境中的催化和降解作用156

11.1生物降解157

11.2生物催化163

11.3生物催化和生物降解的信息学165

11.4总结166

第12章 基因组学在环境中对抗菌药物的发现及影响167

12.1抗生素药物筛选简介167

12.2抗生素药物发现的历史进程168

12.3新药物开发所遇到的挑战169

12.4微生物基因组学和药物靶点的筛选173

12.5确定治疗用途：药物靶点筛选和验证178

12.6基因组学和毒理学：毒物基因组学的产生184

12.7总结186

第13章 基因组学与酶的发现和疫苗开发188

13.1酶的发现188

13.2疫苗的开发196

第14章 生态与环境基因组展望204

14.1基因组发展的领域204

14.2基因组学在生态环境中的实际应用211

参考文献217