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第1章 引言1

1.1什么是R？1

1.2下载和安装R2

1.3最初印象5

1.4脚本代码7

1.4.1编程的艺术7

1.4.2录入脚本代码7

1.5 R的图形设备10

1.6编辑12

1.7帮助文件和新闻组13

1.8程序包16

1.8.1包含在底层安装的包16

1.8.2不包含在底层安装的包17

1.9 R的一般问题19

1.9.1退出R和设置工作目录21

1.10历史和文献概述22

1.10.1 R的一个简短历史回顾22

1.10.2有关R的书籍和使用R的书籍22

1.11使用这本书24

1.11.1如果你是一位教师25

1.11.2如果你是有一定R知识的感兴趣的读者25

1.11.3如果你是一个R专家26

1.11.4如果你比较害怕R26

1.12引用R和引用程序包26

1.13我们学习了哪些R函数？27

第2章R中的数据输入28

2.1 R中的第1步28

2.1.1小型数据库中的数据录入28

2.1.2应用c函数连接数据30

2.1.3使用c，cbind和rbind结合变量32

2.1.4使用vector函数结合数据37

2.1.5使用矩阵结合数据38

2.1.6使用data.frame函数结合数据40

2.1.7使用list函数结合数据41

2.2数据的载入45

2.2.1 Excel中的数据载入45

2.2.2从其它统计程序包中访问数据49

2.2.3访问数据库50

2.3我们学习了哪些R函数？52

2.4习题52

第3章 访问变量和处理数据子集55

3.1访问数据框变量55

3.1.1 str函数56

3.1.2函数中的数据参数58

3.1.3？符号58

3.1.4 attach函数59

3.2访问数据子集61

3.2.1数据排序64

3.3使用相同的标识符组合两个数据集64

3.4输出数据66

3.5重新编码分类变量68

3.6我们学习了哪些R函数？71

3.7习题71

第4章 简单的函数73

4.1 tapply函数73

4.1.1计算每个时间截面的均值74

4.1.2更高效地计算每个时间截面的均值75

4.2 sapply函数和lapply函数76

4.3 summary函数77

4.4 table函数78

4.5我们学习了哪些R函数？80

4.6习题80

第5章 基础绘图工具简介81

5.1 plot函数81

5.2符号、颜色和尺寸84

5.2.1改变绘图字符84

5.2.2改变绘图符号的颜色88

5.2.3改变绘图符号的尺寸89

5.3添加一条平滑线90

5.4我们学习了哪些R函数？93

5.5习题93

第6章 循环与函数94

6.1循环简介94

6.2循环96

6.2.1像建筑师那样设计代码97

6.2.2第1步：载入数据97

6.2.3第2步和第3步：绘制散点图并添加标签98

6.2.4第4步：设计通用代码99

6.2.5第5步：保存图像100

6.2.6第6步：构造循环102

6.3函数103

6.3.1零和空103

6.3.2技术信息105

6.3.3零和空的第二个示例106

6.3.4具有多个参数的函数108

6.3.5稳健的函数110

6.4函数和if指令的其它问题112

6.4.1再做一次建筑师113

6.4.2第1步：载入并评估数据113

6.4.3第2步：每个站点的生物总量114

6.4.4第3步：每个站点的丰富度115

6.4.5第4步：每个站点的香农指数116

6.4.6第5步：结合代码117

6.4.7第6步：将代码置入函数中117

6.5我们学习了哪些R函数？119

6.6习题120

第7章 图形工具121

7.1饼图121

7.1.1禽流感数据的饼图121

7.1.2 par函数124

7.2条形图和带形图125

7.2.1使用禽流感数据绘制条形图125

7.2.2显示均值和标准差的条形图127

7.2.3海底数据的带形图129

7.3盒形图130

7.3.1显示猫头鹰数据的盒形图130

7.3.2显示海底数据的盒形图133

7.4克里夫兰点图135

7.4.1在克里夫兰点图上添加均值136

7.5重新访问plot函数138

7.5.1普通的plot函数138

7.5.2 plot函数的更多选项139

7.5.3增加额外的点、文本和线141

7.5.4使用type=“n”142

7.5.5图例143

7.5.6识别点145

7.5.7改变字体和字体大小146

7.5.8添加特殊符号146

7.5.9其它有用的函数147

7.6多组图148

7.6.1面板函数149

7.7协同图150

7.7.1单个条件变量的协同图150

7.7.2两个条件变量的协同图154

7.7.3增加协同图的修饰155

7.8组合不同类型的图157

7.9我们学习了哪些R函数？159

7.10习题160

第8章 格包（Lattice Package）简介162

8.1高级格函数（Lattice Function）162

8.2多面板散点图：xyplot163

8.3多面板盒形图：bwplot166

8.4多面板克里夫兰点图：dotplot167

8.5多面板直方图：histogram169

8.6面板函数170

8.6.1第一个面板函数示例170

8.6.2第二个面板函数示例172

8.6.3第三个面板函数示例174

8.7三维散点图、表面图和等高线图177

8.8常见问题178

8.8.1如何改变面板顺序？179

8.8.2如何改变坐标轴的界限和刻度？181

8.8.3在一个面板中绘制多条线182

8.8.4在循环中绘图183

8.8.5更新图形184

8.9还要学什么？185

8.10我们学习了哪些R函数？185

8.11习题185

第9章 常见的R错误188

9.1载入数据的问题188

9.1.1源文件里的错误188

9.1.2小数点或者逗号分隔符188

9.1.3目录名190

9.2绑定苦恼190

9.2.1输入相同的attach命令两次190

9.2.2绑定包含同一个变量名称的两个数据框191

9.2.3绑定一个数据框并演示数据192

9.2.4当使用attach函数后改变数据框193

9.3非绑定苦恼194

9.4零的对数194

9.5各种错误195

9.5.1 1和l之间的区别196

9.5.2 0色彩196

9.6错误地保存R空间197

参考文献200

索引203