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第1章 藏鸡品种资源特征1

1.1 藏鸡的分布和形成1

1.1.1 分布与生境1

1.1.2 形成与历史2

1.2 藏鸡的体型外貌特征2

1.2.1 体型外貌2

1.2.2 体重、体尺2

1.2.3 体重与体尺相关与回归3

1.2.4 体重、体尺主成分分析5

1.3 藏鸡的生产性能6

1.3.1 生长性能6

1.3.2 生长曲线比较7

1.3.3 生长曲线拟合参数9

1.3.4 产蛋性能10

1.3.5 屠宰性能10

1.3.6 藏鸡肉质物理性状12

1.3.7 藏鸡肉氨基酸和肌苷酸含量12

1.4 藏鸡遗传多样性14

1.4.1 体型外貌多样性14

1.4.2 体重、体尺多样性15

1.4.3 分子遗传多态性16

1.5 藏鸡的种质特性21

1.5.1 藏鸡特色性状21

1.5.2 藏鸡开发利用现状22

参考文献22

第2章 高原环境对鸡孵化性能的影响25

2.1 禽蛋人工孵化条件25

2.1.1 温度25

2.1.2 湿度26

2.1.3 气体环境27

2.2 高海拔孵化理论分析28

2.2.1 高海拔孵化气体条件分析28

2.2.2 高海拔地区孵化研究进展30

2.3 自动低氧模拟孵化机31

2.3.1 低氧模拟设备研究进展31

2.3.2 自动低氧模拟孵化机的材料和结构32

2.3.3 技术指标32

2.3.4 工作原理33

2.3.5 孵化机密闭性测试和通气量计算34

2.3.6 常氧孵化测试35

2.3.7 低氧模拟孵化测试35

2.3.8 自动低氧模拟孵化机用途及功能扩展35

2.4 高海拔人工孵化技术优化36

2.4.1 温度和湿度36

2.4.2 种蛋贮存37

2.4.3 种蛋形状38

2.5 藏鸡在不同海拔环境中的孵化性能38

2.5.1 藏鸡在不同海拔环境中的孵化性能38

2.5.2 农大小型蛋鸡及其与藏鸡杂交的种蛋在不同海拔下的孵化比较39

2.6 氧对鸡孵化性能的影响43

2.6.1 低氧模拟孵化43

2.6.2 高海拔增氧孵化46

2.6.3 氧因素与孵化49

参考文献50

第3章 藏鸡高原适应性表型特征54

3.1 外貌和生长适应性特征54

3.1.1 体重54

3.1.2 胫长57

3.2 内脏器官适应性特征59

3.2.1 心脏59

3.2.2 肝脏62

3.2.3 肺脏62

3.2.4 右心指数64

3.3 蛋的适应性特征66

3.3.1 鸟类胚胎的呼吸特性66

3.3.2 藏鸡蛋壳的适应性67

3.4 胚胎发育适应性特征71

3.4.1 鸟类胚胎发育对高原的适应性71

3.4.2 藏鸡胚胎发育的高原适应性72

参考文献78

第4章 藏鸡高原低氧适应性血液生理学基础81

4.1 动物血液生理与氧气运输81

4.1.1 血液对氧的运输能力81

4.1.2 血红蛋白含量82

4.1.3 血氧亲和力82

4.1.4 血液流量83

4.2 藏鸡胚胎期低氧适应血液生理基础83

4.2.1 血液学参数83

4.3 藏鸡生长期低氧适应的血液生理基础95

4.3.1 动物生长期血液生理的低氧适应95

4.3.2 生长期藏鸡血液的生理适应97

参考文献113

第5章 藏鸡高原低氧适应组织学基础116

5.1 动物低氧适应相关组织学研究进展116

5.1.1 血管组织116

5.1.2 脏器组织116

5.1.3 肌肉组织117

5.1.4 高原低氧环境对禽类孵化和胚胎代谢的影响117

5.2 藏鸡胚胎尿囊绒毛膜血管密度117

5.2.1 尿囊绒毛膜（CAM）117

5.2.2 高原孵化尿囊绒毛膜血管密度119

5.3 藏鸡胚胎肝脏的适应性121

5.3.1 藏鸡胚胎肝组织显微结构121

5.3.2 藏鸡胚胎肝功能的适应123

5.3.3 藏鸡胚胎肝脏抗氧化能力的适应126

参考文献128

第6章 藏鸡高原低氧适应能量代谢基础130

6.1 低氧对鸡心肌能量代谢相关指标的影响130

6.1.1 心肌组织乳酸（LA）含量和乳酸脱氢酶（LDH）活性130

6.1.2 琥珀酸脱氢酶（SDH）133

6.2 藏鸡胚胎低氧适应的线粒体呼吸功能134

6.2.1 藏鸡与低地鸡胚胎的常氧和全期低氧模拟孵化134

6.2.2 线粒体呼吸功能135

参考文献143

第7章 藏鸡低氧适应的珠蛋白分子机理144

7.1 高原民族和动物珠蛋白研究进展145

7.1.1 珠蛋白家族成员145

7.1.2 血红蛋白功能与低氧适应147

7.1.3 神经珠蛋白（Neuroglobin,Ngb）与低氧适应155

7.1.4 细胞珠蛋白（Cytoglobin,Cygb）与低氧适应156

7.1.5 肌红蛋白（Myoglobin,Mb）与低氧适应157

7.2 藏鸡血红蛋白珠蛋白基因突变及其表达调控158

7.2.1 藏鸡成年和胚胎血红蛋白低氧适应性功能位点检测和验证158

7.2.2 藏鸡胚胎珠蛋白低氧适应性阶段表达谱168

7.2.3 藏鸡血红蛋白低氧适应的分子机制190

7.3 藏鸡神经珠蛋白（Ngb）基因突变及其表达调控203

7.3.1 Ngb基因SNP检测203

7.3.2 Ngb基因的mRNA表达分析208

7.4 藏鸡细胞珠蛋白（Cygb）基因突变及其表达调控210

7.4.1 Cygb基因SNP的检测210

7.4.2 Cygb基因定量表达212

7.4.3 Cygb蛋白Western blot定量215

7.4.4 Cygb蛋白免疫组化定量217

7.4.5 藏鸡Cygb基因低氧适应性表达机制219

7.5 藏鸡肌红蛋白（Mb）基因突变及其表达调控221

7.5.1 Mb基因SNP检测221

7.5.2 Mb基因定量表达223

7.5.3 Mb基因蛋白定量表达224

7.5.4 心脏肌红蛋白含量225

7.5.5 藏鸡Mb基因低氧适应性表达机制226

参考文献227

第8章 藏鸡血管因子低氧适应分子机理250

8.1 动物低氧反应和适应的血管因子研究进展250

8.1.1 血管内皮生长因子250

8.1.2 一氧化氮251

8.1.3 血管紧张素253

8.1.4 内皮素254

8.2 藏鸡诱导型一氧化氮合酶基因功能突变及表达分析254

8.2.1 藏鸡iNOS基因SNP筛选254

8.2.2 藏鸡iNOS基因SNP检测256

8.2.3 低氧对鸡iNOS基因表达的影响258

8.2.4 iNOS酶活性260

8.3 藏鸡内皮型一氧化氮合酶基因克隆及表达262

8.3.1 鸡eNOS基因克隆262

8.3.2 低氧对eNOS基因mRNA表达的影响265

8.3.3 低氧对鸡胚胎尿囊绒毛膜NOS酶活力的影响267

8.4 藏鸡血管内皮因子基因表达与调控268

8.4.1 藏鸡血管内皮生长因子基因SNP筛选268

8.4.2 VEGF基因的定量表达269

参考文献271

第9章 藏鸡能量代谢相关酶基因低氧适应276

9.1 葡萄糖代谢途径中系列酶的生理功能276

9.1.1 糖酵解途径中系列酶的生理功能276

9.1.2 有氧氧化途径中部分酶的生理功能277

9.2 藏鸡甘油酸激酶基因和醛缩酶-C基因突变及其表达278

9.2.1 甘油酸激酶（PGK）基因和醛缩酶-C（ALD-C）基因的SNP多态性278

9.2.2 SNP与转录因子结合的验证281

9.2.3 PGK基因和ALD-C基因在骨骼肌和大脑组织中的表达283

9.3 藏鸡NADH脱氢酶基因的功能突变及其表达293

9.3.1 ND5基因C1627A突变与胚胎表型293

9.3.2 藏鸡和丝羽乌骨鸡胚胎ND5和NDUFS1基因的表达302

参考文献306

第10章 藏鸡线粒体全基因组307

10.1 线粒体及其氧化磷酸化307

10.1.1 线粒体的结构307

10.1.2 氧化磷酸化308

10.1.3 氧化磷酸化的测定311

10.1.4 影响氧化磷酸化的因素312

10.1.5 低氧对线粒体的损害312

10.2 藏鸡和低地鸡线粒体全基因组的测定和比对313

10.2.1 藏鸡和低地鸡线粒体全基因组序列的测定313

10.2.2 藏鸡和低地鸡线粒体基因组全序列的比对316

参考文献321

第11章 藏鸡高原低氧适应基因表达谱和蛋白质组学323

11.1 基因表达芯片和蛋白质组学的基本原理和方法323

11.1.1 基因表达芯片323

11.1.2 蛋白质组学328

11.2 藏鸡胚胎心脏组织基因组学336

11.2.1 不同氧气浓度下鸡胚胎心脏基因表达谱336

11.2.2 差异表达基因的荧光定量PCR验证341

11.2.3 部分差异表达基因生物学功能浅析342

11.2.4 藏鸡特异性表达的基因及其生物学功能343

11.2.5 全基因组表达图谱的聚类分析346

11.3 藏鸡胚胎肝脏组织蛋白表达谱分析348

11.3.1 肝脏总蛋白提取结果348

11.3.2 蛋白质定量标准曲线349

11.3.3 藏鸡常氧孵化16 d肝脏总蛋白的分离、鉴定、分类和分析350

11.3.4 藏鸡和寿光鸡常氧和低氧孵化16 d表达谱356

11.3.5 藏鸡和寿光鸡低氧孵化胚胎16 d肝脏差异表达蛋白点358

11.4 藏鸡胚胎低氧适应的血浆差异蛋白质组学研究361

11.4.1 藏鸡和寿光鸡孵化胚胎16 d血浆蛋白表达谱361

11.4.2 藏鸡和寿光鸡孵化胚胎16 d血浆差异表达蛋白点361

参考文献363

第12章 高原适应性藏鸡肉用配套系371

12.1 藏鸡肉用配套系孵化性能371

12.1.1 低海拔孵化371

12.1.2 西藏林芝高海拔孵化372

12.1.3 西藏拉萨高海拔孵化376

12.1.4 藏鸡孵化性能遗传特征及配套系杂种优势379

12.2 肉用藏鸡配套系生长性能380

12.2.1 体重生长380

12.2.2 胫长生长381

12.2.3 体重生长模型382

12.2.4 胫长生长模型的比较384

12.2.5 体重生长参数比较385

12.2.6 胫长生长参数比较386

12.2.7 体重累积生长387

12.2.8 胫长累积生长387

12.2.9 体重绝对生长速度388

12.2.10 体重相对生长速度389

12.3 肉用藏鸡配套系产肉性能390

12.3.1 屠宰率390

12.3.2 半净膛率392

12.3.3 全净膛率393

12.3.4 胸肌率393

12.3.5 腿肌率394

12.3.6 翅重率394

12.3.7 腹脂率395

12.3.8 心脏重率395

12.3.9 肝重率396

12.3.10 胃重率397

12.3.11 小肠长度397

12.4 藏鸡肉用配套系肉质性能398

12.4.1 低海拔环境中鸡胸肌肉质398

12.4.2 高海拔环境中鸡胸肌肉质399

12.4.3 胸肌脂肪酸含量400

12.5 成年藏鸡肉用性能研究405

12.5.1 成年藏鸡及其他鸡种屠宰性状405

12.5.2 肉质风味品尝410

参考文献411

附录1 博（硕）士生毕业论文414

附录2 项目参加人员公开发表的有关藏鸡的论文415