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第一章 科学知识的动态特征1

1.1科学前沿2

1.1.1竞争范式6

1.1.2无形学院10

1.1.3概念革命11

1.1.4追溯17

1.2视觉思维20

1.2.1格式塔理论20

1.2.2著名的地图22

1.2.3巴别塔24

1.2.4外层空间的信息26

1.2.5“这不是一个烟斗”29

1.2.6格式塔心理学32

1.2.7信息可视化与可视化分析33

1.3绘制科学前沿38

1.3.1科学图谱39

1.3.2竞争范式的案例40

1.4本书的结构41

第二章 宇宙图谱45

2.1绘图学47

2.1.1主题图50

2.1.2地形图和照相绘图法51

2.2陆地地图52

2.3天体图55

2.3.1天体模型55

2.3.2星座图60

2.3.3宇宙图谱63

2.4生物图谱74

2.4.1 DNA双螺旋结构74

2.4.2针灸图谱76

2.4.3基因组图谱78

2.4.4流感病毒蛋白质序列图79

第三章 关联映射81

3.1关联的作用82

3.1.1我们可以试想83

3.1.2认知图的起源84

3.1.3信息可视化87

3.2结构识别87

3.2.1主题模型88

3.2.2寻径网络尺度89

3.2.3图像间相似性的测度92

3.2.4抽象结构的可视化96

3.2.5知识演进模式和趋势的可视化102

3.3降维106

3.3.1几何相似106

3.3.2多维尺度分析107

3.3.3个体差异分析113

3.3.4线性近似——等距映射115

3.3.5局部线性嵌入118

3.4概念图119

3.4.1卡片分类法119

3.4.2聚类120

3.5网络模型122

3.5.1六度分离理论123

3.5.2随机网络模型理论124

3.5.3厄多斯数125

3.5.4语义网络126

3.5.5网络可视化127

3.6小结130

第四章 探寻轨迹131

4.1信息空间的足迹132

4.1.1旅行推销员问题132

4.1.2虚拟世界中的搜索134

4.1.3信息觅食135

4.1.4觅食过程建模136

4.1.5用户的轨迹142

4.2小结147

第五章 科学知识的结构和动态149

5.1马太效应151

5.2词的图谱154

5.2.1共词图谱154

5.2.2包容指数和包容图谱156

5.2.3 RISC个体发生学157

5.3共被引分析159

5.3.1文献共被引分析160

5.3.2作者共被引分析167

5.4 HistCite176

5.5专利共被引177

5.6小结179

第六章 跟踪竞争范式183

6.1信息科学中的领域分析184

6.2 对胶原蛋白研究的纵向研究186

6.3大灭绝争论188

6.3.1白垩纪—第三纪界线事件189

6.3.2物种大灭绝192

6.4超大黑洞199

6.4.1活跃星系核范式200

6.4.2 AGN范式的发展201

6.5小结205

第七章 寻迹潜在知识领域207

7.1主流知识与潜在知识209

7.2知识发现210

7.2.1未被发现的公开知识210

7.2.2潜在知识领域的可视化216

7.3案例一：斯沃森的影响218

7.4案例二：寻径网络的影响219

7.4.1主流知识领域220

7.4.2潜在知识领域224

7.5案例三：疯牛病（BSE）和变异型克雅氏病（VCJD）229

7.5.1主流知识领域229

7.5.2锰-铜假说233

7.6小结234

第八章 绘制科学图谱237

8.1系统摄动与结构变化238

8.1.1早期迹象238

8.1.2结构变化模型241

8.1.3结构变化指标243

8.1.4统计模型247

8.1.5复杂网络分析（1996～2004）249

8.2再生医学253

8.2.1科学计量学评论254

8.2.2结构与动态256

8.2.3系统级指标261

8.2.4新趋势268

8.2.5经验教训271

8.3论文撤销分析272

8.3.1撤销文献的研究275

8.3.2撤销的时间278

8.3.3被撤销文章的内容279

8.3.4自闭症和疫苗283

8.3.5小结286

8.4全域科学图谱和叠加图286

8.4.1科学学科图谱287

8.4.2跨学科和相互叠加292

8.4.3双图叠加295

第九章 可视化分析299

9.1 CiteSpace软件300

9.2 Jigsaw软件304

9.3 Carrot软件307

9.4电力网络分析308

9.5 Action Science Explorer（iOpener）软件309

9.6对2002年“十大挑战”的修改311

9.7展望未来316

参考文献319

致谢345