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目录1

第一章 系统生物学与进化研究及其有关学科的关系1

第一节 系统生物学及其发展1

第二节 关于生命起源的问题6

第三节 动物进化的例证7

一、比较解剖学的例证7

二、胚胎学的例证7

三、古生物学的例证8

四、动物地理学的例证9

五、生理、生化的例证13

六、遗传学例证17

七、返祖现象和形态特征演化的例证18

第四节 进化原因的探讨——进化理论18

一、达尔文的进化理论19

二、进化的动因——自然选择20

第五节 动物进化规律和进化谱系22

第六节 动物地理区划与海洋渔区划分26

一、动物的分布26

二、世界及我国陆地动物地理区系划分28

三、世界海洋渔区的划分与产量分布30

第七节 动物生态学与环境概要34

一、动物生态学34

二、环境保护35

复习题36

参考文献37

第二章 系统原理与生物系统39

第一节 系统原理40

一、什么是系统原理40

二、起源与发展的关系42

三、连续性与间断性的统一43

第二节 生物的一级分类系统43

二、三界系统44

一、两界系统44

三、四界系统45

四、五界系统46

五、六界系统46

复习题47

参考文献48

第三章 系统生物学的发展与分支系统学49

第一节 系统生物学的发展49

第二节 系统生物学内部学派的争论51

一、传统进化系统学派52

二、表相学派52

三、支序系统学派53

第三节 分支系统学的原理与方法58

一、Hennig分支系统学（支序系统学）的基本原理58

二、单系、并系和复系59

三、姐妹群与特征镶嵌66

一、使用外类群法68

第四节 特征分析68

二、有关资料的收集69

三、特征分析的要点71

四、特征分析的事例（三种方法的介绍）73

五、不可混淆的问题81

复习题84

参考文献85

第四章 物种概念与物种形成和保护86

第一节 物种概念86

第二节 亚种分化89

第三节 物种形成90

一、生殖隔离的因素90

二、物种形成的方式91

三、隔离机制与物种形成91

四、物种的真实性92

第四节 物种的生殖属性和表型属性的关系94

第五节 物种多样性保护的研究95

二、物种生物多样性分析98

一、物种多样性研究程序98

三、物种多样性保护的编目程序和原则100

第六节 物种濒危等级102

一、濒危等级划分的标准102

二、国际贸易公约（CITES）附录等级标准的扼要说明109

三、物种保护的优先原则110

复习题115

参考文献115

第五章 支序系统学与生物地理学117

第一节 生物地理学的理论基础117

一、生物区系及特征种类117

二、扩散概念118

三、起源中心118

四、隔离分化119

一、传统的演化生物地理学（evolutionary biogeogrophy）120

第二节 生物地理学的重大变革120

二、系统发育生物地理学（Phylogenetic biogeography）121

三、隔离分化生物地理学123

四、Rosen（1979）对中美洲花鳉鱼类两属的分析127

第三节 国内有关生物地理学的主要论述131

一、河西阿拉善内流区的鱼类区系和地理区划131

二、青海省可可西里地区与周邻水域的鱼类地理学关系139

复习题146

参考文献146

第六章 生物化学在系统生物学中的应用149

第一节 生物体内分子特征149

第二节 关于核酸150

一、细胞内DNA含量的比较151

二、DNA中G·C含量的比较152

三、DNA的杂交153

第三节 关于蛋白质154

四、DNA和RNA的杂交154

一、血清反应155

二、以电泳和层析法测定并绘制蛋白质的“轮廓”157

三、蛋白质分子中氨基酸次序的测定159

第四节 关于其他成分159

一、游离氨基酸的层析160

二、色素的分析160

一、RAPD的原理及研究现状162

第五节 现代分子生物学技术在系统生物学中的应用162

二、现代分子生物学技术在系统生物学中的应用163

第六节 PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用168

一、PCR介导的DNA序列系统分析技术的优点168

二、DNA序列系统分析的应用范围170

三、有关PCR介导的DNA序列系统分析的争议172

四、PCR介导的DNA序列系统分析的应用前景173

第七节 本章小结174

参考文献178

复习题178

附录Ⅰ 常见动物的主要特征183

一、昆虫纲分类常用的主要特征183

二、鱼纲（鲤形目鱼类代表）常用鉴别特征及其性状说明191

三、两栖纲（Amphibia）201

四、爬行纲（Reptilia）208

五、鸟纲（Aves）210

六、哺乳纲（Mammalia）219

附录Ⅱ 常见植物的识别和鉴定225

第一节 常见孢子植物的识别和鉴定225

一、常见的藻类225

二、常见的真菌230

三、常见的地衣231

四、常见的苔藓植物232

五、常见的蕨类植物232

第二节 常见种子植物的识别和鉴定233