图书介绍

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生物信息学
  • 张阳德编著 著
  • 出版社: 北京:科学出版社
  • ISBN:7030123190
  • 出版时间:2004
  • 标注页数:349页
  • 文件大小:30MB
  • 文件页数:362页
  • 主题词:生物信息论-高等学校-教材

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图书目录

第一章 概论1

1.1生物信息学产生的背景1

1.2人类基因组计划2

1.3什么是生物信息学3

1.4生物信息学的研究目标和内容5

1.5生物信息学的发展7

1.6生物信息学研究方法的新进展8

1.7国内外对生物信息学研究现状9

1.8生物信息学的主要意义和展望11

1.9生物信息学与生物实验的关系12

主要参考文献13

第二章 生物学基础14

2.1生命起源和分子进化14

2.1.1生命起源的三个阶段14

2.1.2生命起源的假说15

2.1.3生命起源物质组成的争论15

2.2生物的分类17

2.3核酸19

2.3.1核酸的化学组成19

2.3.2 DNA的一级结构20

2.3.3 DNA的二级结构22

2.3.5生物体中的DNA24

2.3.4 DNA的三级结构24

2.3.6 RNA的结构25

2.3.7核酸的变性、复性与杂交27

2.4蛋白质28

2.4.1蛋白质的组成28

2.4.2蛋白质的分子结构29

2.5染色体和基因39

2.5.1染色体和染色质39

2.4.3蛋白质结构预测和分子设计39

2.5.2基因及真核生物基因组40

2.6中心法则45

2.6.1中心法则的内容45

2.6.2 DNA的复制49

2.7基因工程技术简介49

2.7.1概论49

2.7.2基因克隆的技术路线50

2.7.3基因组文库57

2.7.4重组DNA技术在医学生物学中的应用59

3.1 Internet入门62

3.1.1 Internet浅述62

第三章 计算机网络基础62

3.1.2 Internet服务65

3.1.3 Internet工作原理69

3.2 Internet Explorer简介70

3.2.1 Internet Explorer真面目71

3.2.2 IE的特点71

3.3电子邮件基础知识72

3.3.1电子邮件的特点72

3.3.2邮件的一些使用技巧73

3.3.3邮件的一些使用注意事项74

3.4.2搜索引擎语法规则75

3.4搜索引擎75

3.4.1有关搜索引擎75

3.4.3使用搜索引擎的策略76

3.5文件传输76

3.5.1文件传输与FIP76

3.5.2在文件传输之前压缩文件77

3.5.3网络电话与会议78

3.6上网安全知识79

3.6.1怎样认识病毒和黑客79

3.6.2电脑病毒与安全80

3.6.3黑客与安全83

3.6.4上网安全问题85

第四章 生物信息数据库及其信息检索86

4.1生物信息数据库的类型86

4.2序列数据库89

4.2.1核酸序列数据库89

4.2.2蛋白质序列数据库105

4.3结构数据库106

4.3.1蛋白质结构数据库107

4.3.2数据库结构显示程序109

4.4生物数据库的信息检索112

4.4.2 Entrez系统113

4.4.1 Retrieve服务器113

4.4.3 SRS检索工具116

4.5向数据库提交数据122

主要参考文献122

第五章 序列比对与算法123

5.1序列两两比对123

5.2多序列比对130

5.2.1多序列比对程序CLUSTALW130

5.2.2 tree-based算法和iterative算法131

5.2.3中心算法131

5.3序列分析算法131

5.3.1动态规划算法132

5.3.2隐马尔可夫模型137

5.3.3人工神经网络156

主要参考文献173

第六章 核酸序列分析174

6.1 DNA序列分析的意义174

6.2基因结构175

6.3序列翻译与ORF预测176

6.4核酸序列分析框架178

6.6数据库搜索179

6.5基因识别的两种途径179

6.7生物信息学软件181

6.7.1商业软件包181

6.7.2基于WEB的免费软件包181

6.8新测定DNA序列的分析实例184

6.8.1框架184

6.8.2功能性位点(Pattern或Motif)搜索184

6.8.3编码区的确定186

6.8.4核酸分子的立体结构192

主要参考文献194

7.1蛋白质结构预测195

7.1.1预测蛋白质的物理性质195

第七章 蛋白质结构预测和分子设计195

7.1.2从氨基酸组成辨识蛋白质197

7.1.3蛋白质二级结构预测198

7.1.4其他特殊局部结构202

7.1.5蛋白质的三维结构预测205

7.2蛋白质工程分子设计简介206

7.2.1分子设计的基本条件207

7.2.2分子设计的基本方法209

主要参考文献209

8.1.1问题的提出210

8.1.2发展的历史210

8.1概论210

第八章 人类基因组计划210

8.1.3 HGP的任务与进展211

8.2参与基因组计划的机构212

8.2.1国际机构212

8.2.2其他研究机构214

8.3图谱215

8.3.1遗传图谱215

8.3.2物理图谱217

8.3.3序列图谱219

8.3.4基因图谱219

8.4测序220

8.5基因组序列信息分析工具222

8.5.1 Wisconsin软件包222

8.5.2 ACEDB223

8.5.3其他工具223

8.6人类基因组信息数据库223

8.6.1 NCBI Entrez的染色体图谱224

8.6.2 GDB的染色体图谱224

8.7生物信息学在基因组研究中的应用224

8.7.1当前主要研究内容225

8.7.2生物信息学在基因组研究中的发展趋势230

8.7.3生物信息学的发展展望233

8.8后基因组计划234

8.8.1人类基因组多样性235

8.8.2基因组的表达调控和蛋白产物的功能235

主要参考文献235

第九章 蛋白质组信息学237

9.1蛋白质组学简介237

9.1.1蛋白质组学的概念237

9.1.2蛋白质组研究的理论基础239

9.1.3蛋白质组研究的技术路线239

9.2蛋白质组信息学240

9.3蛋白质组分析的内容和方法242

9.4蛋白质组信息学相关资源245

9.5我国蛋白质组研究进展246

主要参考文献247

第十章 生物信息学前沿248

10.1生物芯片技术248

10.1.1生物芯片简介248

10.1.2与生物芯片相关的技术250

10.1.3生物芯片数据分析252

10.1.4生物芯片数据分析的展望260

10.2.1药物基因组学263

10.2药物设计与生物信息学263

10.2.2药物蛋白质组学266

10.2.3生物信息学、基因组学和蛋白质组学与药物设计270

10.2.4计算机辅助药物设计274

10.2.5药物设计实例285

10.3基因诊断与治疗287

10.3.1基因诊断287

10.3.2基因治疗312

主要参考文献339

附录一 生物信息学名词解释341

附录二 习题346

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