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绪论1

第1章 植物基因组的结构7

1.1 导言7

1.2 DNA的变化——数量7

1.3 染色体变异10

1.4 DNA变异的起源13

1.5 多基因组的结果23

1.6 小结26

1.7 参考文献27

2.1 导言29

第2章 基本工具箱——获得功能基因组数据29

2.2 克隆系统30

2.3 测序策略和自动化技术43

2.4 蛋白质分析44

2.5 数据库与信息学46

2.6 小结49

2.7 参考文献49

第3章 测序的策略51

3.1 导言51

3.2 完全基因组序列的获得53

3.3 物理和遗传学图谱54

3.4 制作物理图谱55

3.5 基因组分段57

3.6 基因组分段的方法58

3.7 基因组测序策略63

3.8 基因组分级分离途径66

3.9 测序和数据加工67

3.10 最有效的方法68

3.11 “完全”基因组序列的可能目标68

3.12 参考文献71

第4章 寻找基因73

4.1 导言73

4.2 从基因组序列鉴定基因74

4.3 全长cDNA的产生78

4.4 全长cDNA测序80

4.5 基因组注释81

4.6 共线性83

4.7 利用诱变确定基因83

4.8 小结91

4.9 参考文献91

第5章 基因表达调控93

5.1 导言93

5.2 基因表达调控需要特异启动子序列95

5.3 增强子元件在基因表达上的作用96

5.4 5′端序列在基因表达中的地位97

5.6 内含子在基因表达中的地位98

5.5 3′端序列在基因表达中的地位98

5.7 真核生物启动子的保守序列99

5.8 反式作用因子调控基因表达100

5.9 mRNA的稳定性101

5.10 植物中化学调控基因的表达102

5.11 染色质结构的影响103

5.12 翻译调控105

5.13 小结105

5.14 参考文献105

第6章 功能基因组学107

6.1 导言107

6.2 表达谱109

6.3 蛋白质组120

6.4 小结127

6.5 参考文献127

第7章 植物体与外界环境的相互作用129

7.1 导言129

7.2 生物因子的相互作用130

7.3 非生物作用139

7.4 参考文献142

第8章 复杂性状的确定和操作145

8.1 导言145

8.3 分子标记系统147

8.2 分子图谱147

8.4 确定QTL150

8.5 分子标记辅助选择158

8.6 参考文献162

第9章 生物信息学165

9.1 导言165

9.2 数据库166

9.3 信息处理工具169

9.4 蛋白质鉴定和比较178

9.5 比较基因组学180

9.6 数据的意义181

9.8 参考文献184

9.7 小结184

第10章 生物伦理学和植物基因组学的未来187

10.1 导言187

10.2 安全问题189

10.3 贸易问题190

10.4 公众的态度190

10.5 公共策略问题194

10.6 小结196

10.7 参考文献196

后记198

索引199