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第一章 核酸的化学组成1

1.1 碱基1

1.2 戊糖3

1.3 核苷5

1.4 核苷酸7

1.5 核酸的修饰组分8

1.6 核酸组分的分离纯化9

参考文献10

第二章 核酸的物化性质12

2.1 核酸在细胞中的存在状态和分布12

2.2 核酸的物化性质14

2.2.1 核酸的紫外吸收14

2.2.2 核酸的粘度15

2.2.3 核酸的沉降特性16

2.2.4 核酸的酸碱性质17

2.3 DNA的变性与复性18

2.3.1 DNA二级结构的稳定因素18

2.3.2 变性24

2.3.3 复性30

2.3.4 核酸的杂交35

参考文献36

第三章 DNA的结构37

3.1 DNA的一级结构38

3.2 DNA的二级结构44

3.2.1 双螺旋模型的依据46

3.2.2 双螺旋模型的主要特征47

3.3 DNA的三级结构52

3.3.1 超螺旋53

3.3.2 生物体内的超螺旋61

参考文献69

第四章 DNA的变异结构71

4.1 单链核酸的自组装结构72

4.1.1 单链核酸内部的二级结构72

4.1.2 单链螺旋74

4.1.3 α-DNA75

4.1.4 简单序列的自组装结构77

4.2 DNA双螺旋结构78

4.2.1 Watson-Crick双螺旋结构的构象变异78

4.2.2 平行双螺旋DNA(P-DNA)95

4.3 DNA的多链结构97

4.3.1 G-四碱基体型四螺旋DNA97

4.3.2 含质子化C的四螺旋DNA102

4.3.3 四螺旋DNA可能的生物学意义102

参考文献105

第五章 三螺旋DNA的物化性质109

5.1 历史背景109

5.2 三螺旋DNA的形成111

5.2.1 分子内三螺旋(H-DNA)112

5.2.2 分子间三螺旋121

5.2.3 平行三螺旋DNA123

5.3 三螺旋DNA的结构124

5.3.1 三碱基体124

5.3.2 Py-型三螺旋DNA的结构126

5.3.3 Pu-型三螺旋DNA的结构131

5.4 三螺旋DNA的热力学132

参考文献137

第六章 寡聚核酸的合成及其改性144

6.1 核酸的化学合成145

6.1.1 磷酸二酯合成法145

6.1.2 磷酸三酯法146

6.1.3 亚磷酸三酯法147

6.1.4 固相自动合成法148

6.1.5 化学合成DNA片段的分离和纯化149

6.2 核酸的酶促合成152

6.3 化学修饰的寡核苷酸155

6.3.1 核糖基修饰156

6.3.2 磷酸骨架的改性159

6.3.3 寡聚核苷酸偶联物164

6.3.4 碱基改性167

6.4 寡聚核酸的应用168

6.4.1 基因的合成168

6.4.2 基因表达的调控系统169

6.4.3 DNA的序列分析169

6.4.4 基因的分离170

6.4.5 基因突变及蛋白质结构功能的研究171

6.4.6 制备限制性内切酶识别序列的接头172

6.4.7 人类基因病的诊断探针173

参考文献174

第七章 三螺旋DNA与双螺旋DNA的识别与切割176

7.1 双螺旋DNA的识别系统177

7.1.1 DNA结合蛋白质177

7.1.2 DNA小沟结合配基180

7.1.3 寡聚核酸181

7.2 双螺旋DNA的精确切割183

7.2.1 限制性内切酶184

7.2.2 DNA断裂的小分子配基186

7.2.3 序列特异性DNA断裂蛋白质190

7.3 三螺旋DNA与双螺旋DNA的定点切割192

7.3.1 Achilles切割技术192

7.3.2 ODN定位三螺旋的形成与基因组DNA的切割194

7.3.3 RecA酶介三螺旋的形成与基因组DNA的切割198

参考文献199

第八章 三螺旋DNA与反基因战略202

8.1 基因的转录与表达203

8.1.1 基因的复制204

8.1.2 基因的转录208

8.1.3 翻译211

8.2 基因的调控213

8.2.1 转录水平的调控214

8.2.2 翻译水平的调控215

8.2.3 生长和发育过程中的基因调控216

8.3 寡聚核酸与基因调控217

8.3.1 反义RNA219

8.3.2 反义DNA221

8.3.3 Ribozyme221

8.3.4 反义技术的可能机理222

8.3.5 反义技术的应用和难题224

8.4 三螺旋DNA与反基因战略225

8.4.1 反基因战略的原则226

8.4.2 反基因战略的机理227

8.4.3 涉及整胞的研究232

8.4.4 反基因ODN作为药物的可能性233

参考文献236

第九章 三螺旋DNA与基因重组240

9.1 基因重组242

9.1.1 同源重组242

9.1.2 位点特异性基因重组256

9.1.3 复制性重组——转座子261

9.2 平行三螺旋DNA与同源重组263

9.2.1 RecA蛋白263

9.2.2 RecBCD蛋白266

9.2.3 平行三螺旋DNA268

9.2.4 同源寻找导致R-DNA的形成271

9.2.5 R-DNA与减数分裂272

9.2.6 R-DNA与同源重组的起始专一性273

参考文献276

第十章 三链DNA新结构279

10.1 新结构DNA的形成与性质280

10.2 新结构DNA的有序性285

10.3 新结构DNA形成的可能机理和结构288

10.4 三链辫状结构的可能生物学意义292

参考文献292