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第一篇 医学与流行病中的统计方法3

第一章 医学中统计思维的历史&陈达 方积乾3

第一节 引言3

第二节 Laplace及其远见3

第三节 Louis与数值方法4

第四节 统计分析与实验室研究5

第五节 现代统计学的开端6

第六节 医学统计学的开端7

第七节 实验中的随机化8

第八节 第一个随机化有对照的临床试验8

第九节 政府法规与统计学9

第十节 尾声10

参考文献11

第二章 数据描述、变异建模与统计实践&杜鸿雁 谭铭 陈豪 金华14

第一节 概述14

第二节 描述数据的方法15

第三节 通过模型调整因素来描述数据19

第四节 过度离散问题19

第五节 统计实践22

参考文献29

第三章 生存变量的预后生物标记物的协变量特异和协变量校正的预测方法&马昀蓓 周晓华 KC Gary Chan 赵星 李晓松32

第一节 前言32

第二节 协变量特异时依PPV曲线33

第三节 协变量校正时依PPV曲线36

第四节 模拟研究38

第五节 多中心艾滋病队列研究42

第六节 讨论43

参考文献48

第四章 个体化治疗的统计学方法&田鲁 赵晓光 陈新林50

第一节 简介50

第二节 个体化治疗的风险预测50

第三节 个体化治疗的选择54

第四节 讨论60

参考文献60

第五章 统计学方法在放射医学研究的质量控制、质量保障和质量改进中的应用&陆盈 赵守军 颜杰64

第一节 序言64

第二节 测量误差65

第三节 统计过程控制图76

第四节 一致性评价84

第五节 校准和标准化92

第六节 结论96

参考文献96

第六章 统计方法在医学图像分析中的应用&金声 赵耐青102

第一节 概述102

第二节 应用图像的统计特性进行采样和压缩103

第三节 用各向异性统计扩散减少噪声106

第四节 医学图像的分割110

第五节 利用3维Monte Carlo模拟改进图像配准的置信区间115

第六节 结论117

参考文献117

第七章 成本效果分析与循证医学&李建立 宇传华121

第一节 前言121

第二节 成本-效果分析的基础123

第三节 统计方法125

参考文献142

第八章 与健康有关生存质量研究的统计设计与分析&郝元涛 方积乾144

第一节 生存质量的概念及发展144

第二节 生存质量测定量表的研制方法146

第三节 生存质量测定量表的国际化方法149

第四节 生存质量研究的设计与实施152

第五节 生存质量资料的特点及相应的统计分析方法156

第六节 心理统计的基本原理与方法162

参考文献172

第九章 Meta分析&周旭毓 方积乾 宇传华 许宗利 田鲁 陆盈175

第一节 Meta分析概述175

第二节 Meta分析的常用统计方法183

第三节 Meta分析的Bayes方法204

第四节 诊断试验的meta分析213

第五节 适宜于连锁分析文献的meta分析方法228

第六节 Meta分析中的偏倚235

参考文献240

第十章 传染病模型&武虎林 赵守军 王显红245

第一节 概述245

第二节 流行病学数学统计模型246

第三节 病毒动力学模型254

第四节 干预和预防257

第五节 小结263

参考文献263

第十一章 抽样调查中的特殊模型&高素娟 高桂明 方积乾270

第一节 估计疾病患病率的模型271

第二节 小区域分析的随机效应模型274

第三节 捕获-再捕获模型281

参考文献286

第十二章 重复捕取（捕获-再捕获）方法在流行病监测上的应用&赵莲菊 谢宗震 杨欣洲289

第一节 前言289

第二节 重复捕取的背景与动机295

第三节 不考虑协变量的模型298

第四节 包含协变量的模型310

第五节 结论与讨论317

参考文献317

第十三章 疾病筛查资料的统计方法&柳青321

第一节 疾病筛查的基本概念321

第二节 筛查疾病自然史的一阶段简化模型325

第三节 筛查疾病自然史的两阶段模型328

第四节 筛查疾病自然史的多阶段马尔科夫链随机模型332

第五节 筛查方案的模拟评价及优化339

参考文献342

第二篇 临床试验中的统计方法347

第十四章 统计学在生物制药研发中的应用&周贤忠 彭安佩 张新佶 贺佳347

第一节 医药研发347

第二节 主要统计学原则348

第三节 生物利用度与生物等效性352

第四节 有重复记录的QT/QTc研究357

第五节 全球性临床试验进展367

第六节 影像诊断中的统计379

第七节 GCP中的统计原则384

参考文献388

第十五章 药理学和临床前研究的统计学&黎子良 施美琼 朱光锐 王强396

第一节 引言396

第二节 药物动力学和药效学397

第三节 生物利用度和生物等效性409

第四节 测定方法的开发与确证412

第五节 药物开发412

参考文献413

第十六章 毒理学的统计方法&陈章荣 李妍 宇传华417

第一节 动物致癌试验417

第二节 生殖研究427

第三节 混合试验432

参考文献437

第十七章 健康危险度评价中的剂量-反应模型&朱怡良 孙晓武441

第一节 引言441

第二节 两分类数据：致癌性443

第三节 聚集性多项数据：发育毒性445

第四节 纵向数据：神经行为毒性检测448

第五节 基准剂量454

第六节 讨论455

参考文献455

第十八章 确证性临床试验中的统计学基本问题&季渝华 许海燕 刘清 夏结来459

第一节 引言459

第二节 最小化可能引入的偏倚461

第三节 第Ⅰ类错误率的控制467

第四节 期中分析、成组序贯设计与适应性设计478

第五节 阳性对照试验482

参考文献490

第十九章 定性评价处理作用的替代指标&耿直498

第一节 引言498

第二节 定义和记号499

第三节 基于因果性先验知识的替代指标准则505

第四节 基于关联性先验知识的替代指标准则508

第五节 讨论510

参考文献511

第二十章 临床研究中的动态试验设计&彭安佩 周贤忠 刘裕513

第一节 简介513

第二节 什么是动态设计514

第三节 方案修订的影响518

第四节 按照设计调整的挑战520

第五节 回顾性调整的困难525

第六节 结束语527

参考文献528

第二十一章 中医研究中的统计方法&易丹辉 李扬533

第一节 概述533

第二节 中医证候评价研究534

第三节 中医症状筛选研究540

参考文献546

第三篇 遗传研究中的统计方法551

第二十二章 稀疏片段识别及拷贝数变异分析的应用&郑欣格 蔡天文 李宏哲 肖云 范慧慧 平艳艳 李霞551

第一节 背景551

第二节 基于SNP芯片获取的LogR比值数据进行单样本最优拷贝数变异识别552

第三节 基于单样本第二代测序数据的具有鲁棒性的拷贝数变异识别555

第四节 基于群体样本对重复出现的拷贝数变异的识别560

第五节 讨论562

参考文献564

第二十三章 连锁研究设计与分析的统计方法&李启寨 覃红 李照海 郑刚 李彩霞567

第一节 绪言567

第二节 连锁分析571

第三节 讨论580

第四节 软件580

参考文献580

第二十四章 用新一代测序技术的转录组分析&李婧翌 黄海艳 钱敏平 张学工584

第一节 引言584

第二节 序列数据产生的综述585

第三节 讨论592

参考文献594

第二十五章 人类种群遗传结构&唐华 唐鲲599

第一节 引言599

第二节 量化群体结构601

第三节 人群结构的经验数据605

第四节 近期的遗传混合607

第五节 遗传关联研究中的种群结构和混淆情况608

第六节 结束语610

参考文献610

第二十六章 全基因组关联研究中的数据整合方法&孙宁 赵宏宇 伍亚舟 易东614

第一节 引言614

第二节 GWAS分析中不同的数据类型615

第三节 整合不同数据类型的统计方法617

第四节 讨论620

参考文献621

第四篇 通用的概率统计理论与方法627

第二十七章 统计因果推断&耿直627

第一节 引言627

第二节 Yule-Simpson悖论628

第三节 因果推断的反事实模型629

第四节 混杂偏倚与混杂因素632

第五节 基于因果图的混杂因素的准则640

第六节 多混杂因素643

第七节 纵向研究的因果推断644

第八节 小结645

参考文献645

第二十八章 生存分析&林丹瑜 赵国龙648

第一节 引言648

第二节 基本概念648

第三节 生存分布的估计649

第四节 计数过程理论650

第五节 两样本统计651

第六节 回归模型651

第七节 Cox比例危险率模型652

第八节 相乘性强度模型653

第九节 回归模型诊断654

第十节 Cox模型的替代模型655

第十一节 多元失效时间资料656

第十二节 结语657

参考文献658

第二十九章 纵向数据分析的回归模型&伍鸥 田欣 余启汾 吴密霞663

第一节 引言663

第二节 参数、半参数方法概述669

第三节 变系数非参数模型676

第四节 基于分布函数的非参数模型693

第五节 结果自适应协变量的回归方法701

参考文献715

第三十章 核密度估计和非参数局部多项式回归&范剑青 李润泽 颜杰720

第一节 引言720

第二节 密度估计720

第三节 局部多项式拟合727

第四节 局部似然函数和局部部分似然函数733

第五节 非参数拟合优度检验739

第六节 其他应用744

参考文献749

第三十一章 非独立数据的统计分析方法&陈峰754

第一节 常见的非独立数据实例755

第二节 常见的非独立数据的组内相关结构765

第三节 传统方法及其局限性769

第四节 非独立数据的广义估计方程774

第五节 非独立数据的多水平模型778

第六节 组内相关系数的区间估计及抽样分布786

第七节 非独立试验的样本含量及成本效益790

参考文献794

第三十二章 Bayes方法&陈明辉 叶可英 曹文君 徐勇勇796

第一节 概述796

第二节 后验推断797

第三节 先验的选取804

第四节 Bayes计算812

第五节 Bayes非劣效临床试验设计817

第六节 应用与实例821

参考文献835

第三十三章 合适的无先验概率推断及其在医学统计中的应用&Duncan Ermini Leaf Hyokun Yun 刘传海 李松 金华844

第一节 引言844

第二节 推断模型（IM）846

第三节 条件推断模型和边际推断模型850

第四节 受约束推断模型853

第五节 选择推断856

第六节 基于二项分布数据的推断858

第七节 Meta分析：多正态均值问题861

参考文献865

第三十四章 随机过程及其在医学中的应用&李彩霞 方积乾868

第一节 Markov链868

第二节 Markov链的应用874

第三节 一些特殊的Markov链880

第四节 Markov链在统计计算中的应用——MCMC方法886

第五节 基于Markov链的流行病传播模型891

第六节 计数过程与生存资料回归模型893

参考文献897

第三十五章 时间序列中的缺失值填补和移动假日效应的调整&张晋昕 张熙 薛允莲 赵志899

第一节 基于周期信息的时间序列缺失值填补方法899

第二节 逐日观测序列移动假日效应的调整909

参考文献917

第三十六章 树形法&张和平 宇传华919

第一节 前言919

第二节 CART的基本知识919

第三节 生存树923

第四节 多元反应变量的分类树925

第五节 结束语927

参考文献927

第三十七章 BP神经网络模型简介&夏结来 唐启义930

第一节 神经网络简介930

第二节 BP神经网络931

第三节 DPS数据处理系统操作步骤933

第四节 应用实例934

第五节 基于遗传算法的人工神经网络936

第六节 未来发展之预测939

参考文献940