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第一篇 非编码小分子RNA概论3

第一章 miRNA研究历史3

第一节 miRNA：非编码RNA家族新贵4

一、非编码RNA家族4

二、miRNA与siRNA6

第二节 miRNA的发现及其启示7

一、lin-4在1993：第一个miRNA的发现8

二、let-7在2000：第二个miRNA的发现9

三、miRNA在2001： miRNA时代的开启9

四、miRNA命名体系10

五、发现miRNA给我们的启迪11

第三节 miRNA研究学科的发展历程14

第四节 miRNA研究前景展望20

第二章 miRNA生物学过程29

第一节 miRNA的生物合成和修饰30

一、miRNA的生物合成30

二、miRNA的基因修饰34

第二节 miRNA的生物学功能35

一、miRNA对基因的表达调控35

二、miRNA与靶基因之间的相互关系38

第三节 miRNA转运体40

一、囊泡类转运体40

二、脂蛋白41

三、RNA结合蛋白42

第三章 细胞外的miRNA46

第一节 体液miRNA的检测47

第二节 循环血液中miRNA48

一、心血管系统疾病与血液miRNA48

二、肿瘤疾病与血液miRNA52

第三节 其他体液中的miRNAs59

第四节 展望60

第二篇 miRNA与心脏生理和病理79

第四章 miRNA与心脏发育79

第一节 心脏发育的生理过程80

一、心脏发育概述80

二、心脏发育的生理过程80

第二节 miRNA对心脏发育的调控80

一、miRNA对心脏胚胎发育的影响80

二、miRNA对心肌细胞分化及发育的影响81

三、展望84

第五章 miRNA调控心脏节律86

第一节 生理性心脏节律的调节87

一、心脏电生理学基础87

二、心肌细胞离子通道88

三、细胞膜受体蛋白89

四、缝隙连接蛋白对心脏节律的调节90

第二节 miRNA对心脏节律的调节90

一、miRNA对离子通道蛋白的调节90

二、miRNA对缝隙连接蛋白的调节91

三、miRNA对细胞膜受体蛋白的调节92

第六章 miRNA调控心肌收缩94

第一节 心肌收缩的生理机制95

第二节 miRNA对心肌收缩的调节96

一、miRNA调控肌球蛋白重链96

二、miRNA调控细胞骨架96

三、miRNA调控兴奋收缩耦联97

第七章 miRNA与心肌肥厚100

第一节 心肌肥厚的病理过程101

一、心肌肥厚的结构重塑101

二、心肌肥厚的信号转导通路101

第二节 miRNA对心肌肥厚的调控102

一、miRNA参与心肌肥厚发生的调控103

二、miRNA参与心肌肥厚时细胞骨架蛋白的调控104

三、miRNA参与心肌肥厚过程中心肌细胞凋亡的调控105

四、miRNA参与糖尿病性心肌肥厚的调控105

五、其他105

六、展望106

第八章 miRNA与心肌纤维化108

第一节 心肌纤维化及其发生机制109

一、成纤维细胞与心肌纤维化109

二、心肌纤维化的分子机制109

第二节 miRNA与心肌纤维化110

一、miRNA与心肌纤维化研究的开端（2008—2010年）110

二、miRNA与心肌纤维化研究的发展（2011年至今）111

三、miRNA与心肌纤维化研究的展望113

第九章 miRNA与心肌细胞凋亡115

第一节 心肌细胞凋亡的信号通路116

一、死亡受体途径116

二、线粒体途径117

三、内质网途径117

四、其他死亡途径118

第二节 miRNA对心肌细胞凋亡的调节119

一、促进心肌细胞凋亡的miR NAs119

二、抑制心肌细胞凋亡的miRNA121

三、miRNA—miRNA相互作用模式对心肌细胞凋亡的调控122

四、miRNA—long non-coding RNA相互作用对心肌细胞凋亡的调节123

五、miRNA介导药物对心肌细胞凋亡的调节124

六、展望124

第十章 miRNA与心肌自噬129

第一节 心肌自噬的生理过程130

一、心肌自噬的发生过程及调控130

二、心肌自噬的生理功能131

第二节 miRNA对心肌自噬的调控131

一、miRNA调节自噬基因的表达132

二、miRNA在心脏疾病中对自噬的调控135

三、展望139

第十一章 miRNA与心肌损伤及修复144

第一节 心肌损伤与自我修复的生理机制145

一、干细胞与心脏再生145

二、干预心肌细胞凋亡、自噬、坏死，增加细胞存活通路146

三、心肌胞外基质对心脏再生的影响146

四、心肌细胞缺氧对心肌再生的影响147

第二节 miRNA对心肌损伤与修复的调节147

一、miRNA与干细胞增殖、迁移、分化147

二、miRNA与心肌细胞存活150

三、miRNA与心肌细胞增殖150

四、miRNA与心脏血管生成151

五、miRNA与缺氧所诱导的心肌细胞再生151

第三节 基于miRNA的心肌再生的治疗152

第三篇 miRNA与心脏疾病157

第十二章 miRNA与先天性心脏病157

第一节 先天性心脏病的分类及病理生理158

第二节 miRNA对先天性心脏病的调节159

第十三章 miRNA与心律失常165

第一节 心律失常的发病机制167

第二节 miRNA与心律失常169

第三节 展望177

第十四章 miRNA与心力衰竭181

第一节 心力衰竭的病理生理机制182

第二节 miRNA对心力衰竭病理过程的调节182

一、心力衰竭时miRNA表达谱182

二、miRNA与心肌肥厚183

三、miRNA与心肌纤维化183

四、miRNA与心肌细胞凋亡184

五、miRNA与心律失常184

六、miRNA与炎症反应185

第三节 miRNA在心力衰竭中的应用186

一、miRNA对心力衰竭的诊断和预后评估186

二、miRNA对心力衰竭治疗展望187

第十五章 miRNA与冠状动脉硬化性心脏病191

第一节 冠状动脉硬化性心脏病192

一、冠心病发生的危险因素192

二、冠心病发生的病理机制192

第二节 miRNA对冠心病的病理作用194

一、miRNA对冠状动脉的生理作用194

二、miRNA在冠状动脉硬化性心脏病中病理作用194

第三节 miRNA在冠心病治疗中应用197

一、miRNA临床治疗药物的开发197

二、miRNA临床诊断的应用198

三、展望200

第十六章 miRNA与心脏瓣膜病204

第一节 心脏瓣膜病的病理生理205

第二节 miRNA与心脏瓣膜疾病205

第三节 miRNA调控心脏瓣膜疾病的分子机制206

第四节 循环miRNA在心脏瓣膜疾病诊断与预后评价中的意义208

第五节 展望209

第十七章 miRNA与心肌病211

第一节 心肌病概述212

一、心肌病简介212

二、心肌病的分类212

第二节 miRNA对原发性心肌病的调控213

一、miRNA与扩张型心肌病214

二、miRNA与肥厚型心肌病215

三、miRNA与限制型心肌病216

第三节 miRNA对继发性心肌病的调控216

一、miRNA与糖尿病型心肌病216

二、miRNA与应激性心肌病219

三、miRNA与病毒性心肌病221

四、miRNA与酒精性心肌病222

五、miRNA与小儿心肌病223

六、miRNA与遗传性心肌病223

七、miRNA与围产期心肌病224

八、miRNA与慢性查加斯心肌病224

九、miRNA与营养不良性心肌病224

第四节 miRNA在心肌病的治疗和诊断中的前景与展望225

第十八章 miRNA与原发性高血压233

第一节 原发性高血压的病理生理及分子机制234

一、原发性高血压定义234

二、原发性高血压的分子机制234

三、原发性高血压的病理生理变化236

第二节 miRNA对血压的调节237

一、心脏中miRNA对血压的调节237

二、血管中miRNA对血压的调节239

三、肾脏中miRNA对血压的调节243

四、神经系统中miRNA对血压的调节245

五、其他单核苷酸多态性对血压的调节246

第四篇 miRNA研究策略及方法255

第十九章 miRNA研究的基本策略255

第一节 miRNA的筛选策略256

一、miRNA的高通量筛选256

二、特征性miRNA的筛选验证策略257

三、特征性miRNA的新型检测方法259

第二节 miRNA对靶基因调节的研究策略260

一、miRNA靶基因的筛选260

二、miRNA对靶基因的调节方式261

三、miRNA对靶基因调控的验证262

第三节 miRNA功能研究263

一、miRNA获得型功能研究263

二、miRNA功能缺失型研究264

三、miRNA功能研究265

第二十章 miRNA的研究万法269

第一节 目的miRNA的筛选方法270

一、基于芯片技术的miRNAs的高通量筛选方法270

二、基于网络数据库的miRNAs的高通量筛选方法277

第二节 miRNA的检测方法280

一、miRNA的提取和富集方法280

二、miRNA的检测及定量分析281

第三节 miRNA的功能分析293

一、生物学实验方法293

二、建立转基因动物研究方法306

第四节 miRNA遗传改变动物306

一、miRNA遗传改变动物简介306

二、miRNA重组体的构建307

三、miRNA腺病毒/慢病毒包装308

四、基因过表达动物模型制备308

五、基因敲减动物模型制备310

六、转基因动物基因型鉴定方法311

七、miRNA敲除小鼠模型的制备311

八、展望312

第二十一章 miRNA的现代生物信息学研究策略与实用方法314

第一节 miRNA靶基因的高通量识别及功能预测315

一、miRNAs序列数据库315

二、miRNA靶基因的高通量实验检测数据的计算分析315

三、miRNA靶基因预测的计算方法317

四、miRNA-靶基因互作数据资源320

五、基于调控的靶基因预测miRNA功能321

第二节 miRNA功能型（应用型）数据资源325

一、miRNA和疾病数据库325

二、miRNA药物影响数据库326

三、转录调控及表观修饰调控数据库326

四、其他328

第三节 miRNA相关组学数据的生物信息学分析策略328

一、miRNA转录组的基本生物信息学分析策略328

二、miRNA相关的DNA甲基化组的基本生物信息学分析策略331

三、miRNA组蛋白修饰组的基本生物信息学分析策略332

四、miRNA组学数据的深层次生物信息分析策略334

第四节 miRNA组学数据的整合生物信息分析策略335

一、miRNAs表达谱与mRNA表达谱的整合分析技术335

二、疾病相关miRNAs的计算识别336

三、miRNAs介导的内源性竞争互作的识别技术338

四、miRNA-miRNA协同调控作用的识别技术340

第五篇 miRNA与心脏疾病药物研发345

第二十二章 miRNA的临床前研究345

第一节 miRNA成药性研究346

第二节 miRNA在疾病治疗中的应用349

一、miRNA在心血管疾病治疗中的应用350

二、mi RN A在肿瘤治疗中的应用351

三、miRNA在其他疾病治疗中的应用351

第三节 miRNA临床前研究面临的困境352

第二十三章 miRNA药物研发的临床研究354

第一节 miRNA药物研发临床研究现状355

一、miRNA作为生物标记物在临床早期诊断的应用355

二、miRNA药物靶向治疗的临床研究现状/miRNA治疗从基础研究到临床应用357

第二节 临床用药对miRNA表达调节的机制359

一、miRNA可能成为药物治疗房颤新的药物作用靶点360

二、肾上腺素受体阻断药以miRNA为靶点发挥抗心肌梗死的作用360

三、中药活性成分丹参酮ⅡA以miRNA为靶点治疗缺血性心律失常360

四、血管紧张素转化酶抑制药调节miRNA的研究361

五、阿司匹林调节miRNA的研究361

第三节 展望362

第二十四章 miRNA干扰技术与miRNA药物研发363

第一节 miRNA干扰技术364

一、miRNA干扰技术概述364

二、miRNA功能增强技术365

三、miRNA功能抑制技术370

第二节 miRNA药物研发377

一、miRNA作为疾病治疗靶点377

二、miRNA-based药物的转运380

三、miRNA药物治疗387

第三节 miRNAi的应用前景390

一、靶向性给药途径390

二、微粒清除系统391

三、多靶基因的疗效不确定性391

四、免疫反应391

中英文名词对照索引395