图书介绍

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分子模拟与计算机辅助药物设计
  • 王莹，顾若需编著 著
  • 出版社： 上海：上海交通大学出版社
  • ISBN：9787313079800
  • 出版时间：2012
  • 标注页数：270页
  • 文件大小：25MB
  • 文件页数：283页
  • 主题词：药物－计算机辅助设计

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图书目录

第1章 分子模拟的数学基础1

1.1 级数1

1.2 积分的概念和方法3

第2章 分子模拟的生物信息学基础13

2.1 序列比对13

2.2 序列分析18

2.3 蛋白质结构预测18

2.4 基因芯片技术25

2.5 各种数据库和网络资源27

参考文献29

第3章 分子模拟的物理和化学基础30

3.1 量子化学计算的基本原理30

3.2 密度泛函理论（Density Functional Theory，DFT）36

3.3 原子间与分子间作用力39

3.4 分子力场44

3.5 几种常见的分子力场49

3.6 溶剂介电质模型51

3.7 多体问题和有效成对势能54

参考文献57

第4章 分子模拟基本算法60

4.1 统计力学基础60

4.2 Monte Carlo模拟63

4.3 分子模拟69

4.4 从头算分子动力学（Ab Initio Molecular Dynamics，AIMD）简介81

4.5 QM/MM简介83

4.6 能量优化算法与过渡态求解88

参考文献91

第5章 蛋白质结构模拟94

5.1 蛋白质结构的预测94

5.2 反相折叠方法114

5.3 从头折叠法116

5.4 常用的网站118

5.5 常用软件119

参考文献121

第6章 药物设计的基本方法123

6.1 早期的探索123

6.2 二维定量构效关系123

6.3 三维定量构效关系128

6.4 更高维定量构效关系142

6.5 数据统计分析方法143

第7章 药物设计的信息系统156

7.1 化学信息系统156

7.2 组合化学信息管理系统159

7.3 生物信息数据库和软件161

7.4 数据库搜索技术168

参考文献171

第8章 计算机辅助药物设计应用实例172

8.1 抗SARS的药物设计172

8.2 HIV蛋白酶抑制剂的筛选196

8.3 流感病毒神经氨酸酶抑制剂的研究204

8.4 定量构效关系与噁唑烷酮抗菌药物的设计233

8.5 抗老年痴呆症的药物筛选248

参考文献266

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