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第一篇　医学科研数据的处理方法1

第一章　多个数据集的横向检查1

第一节　多个数据集变量的汇总报告2

第二节　多个数据集观测对象的汇总报告5

第二章　数据的清错和报告9

第一节　数据集中重复记录的检查和清除9

第二节　数据集中重复编码的检查和清除11

第三节　数据集中重复测量记录数的统计13

第四节　正态分布的连续变量异常值查找和清除15

第五节　偏态分布的连续变量异常值查找和清除17

第六节　数据中变量有效观测数的统计18

第七节　两个数据集的比较20

第三章　数据和变量的预处理23

第一节　多个数据集的合并23

第二节　变量长度的改变25

第三节　数据中数值型变量与字符型变量的相互转换27

第四节　分类变量重新分类29

第五节　连续型变量等分转换成等级变量31

第六节　连续型变量按百分位值分组33

第七节　重复测量值均数的计算35

第一节　家系数据家庭成员关系编码的检查40

第四章　家系结构数据的处理40

第二节　家系数据家庭成员年龄关系的检查41

第三节　家系结构汇总报告43

第四节　根据家系结构挑选家系45

第五节　根据某一表型从家系中挑选极端（或患病）同胞对46

第六节　家系数据结构的转换48

第二篇　医学科研数据的分析方法51

第五章　数据的基本描述与单因素分析51

第一节　自动计算数据集中所有变量的分布55

第二节　连续变量的均数、标准差与百分位数59

第三节　分类变量的交叉频数分布与卡方检验61

第四节　均数的比较——t检验与单因素方差分析63

第五节　均数的比较——两因素方差分析66

第六节　多个分类变量联合的频数分布70

第七节　多个二分类事件各种交叉发生的频率统计74

第六章　线性回归与Logistic回归分析（一）76

第一节　单个暴露因子的线性回归分析80

第二节　单个暴露因子的Logistic回归分析86

第三节　多个暴露因子的回归分析88

第四节　两个或多个暴露因子的交互作用的分析92

第五节　重复测量数据GEE分析方法98

第七章　线性回归与Logistic回归分析（二）102

第一节　其它分布类型因变量的回归分析103

第二节　大批量危险因子的分析108

第三节　筛选预测模型分析112

第四节　连续变量的曲线拟合分析114

第五节　寿命表与COX回归模型分析117

第八章　多元分析与重复测量数据分析123

第一节　异常病例的发现123

第二节　两样本多元比较的T2检验125

第三节　多样本多元比较的方差分析127

第四节　两样本因变量反应曲线图分析129

第五节　混合效应（MIXED）模型分析因变量反应曲线图131

第六节　混合效应（MIXED）模型分析重复测量数据136

第九章　家系研究表型数据的相关分析139

第一节　组内相关系数的计算142

第二节　运用双生子数据计算遗传度143

第三节 同胞之间受累相对危险度估计145

第四节　残差与校正值的计算147

第十章　家系研究基因型与表型的关联分析150

第一节　家系基因数据的孟德尔检错151

第二节　等位基因的Hardy-Weinberg平衡检验153

第三节　以家系为单位的关联分析155

第四节　病例—父母三人资料的TDT分析161

第五节　同胞数据SDT分析163

第六节　对数线性模型用于病例—父母三结构资料的关联分析165

第七节　多位点基因的单倍体型构建169

第八节　病例与对照多位点基因单倍体频率卡方检验173

第三篇　文章实例分析177

第十一章　如何建立数据的分析思路177

第一节　建立数据分析思路的目的和意义177

第二节　建立数据分析思路的前提条件178

第三节　建立数据分析思路需要考虑的几个问题178

第一节　了解数据中变量的类型181

第二节　数据描述与分析方法的选择181

第十二章　数据描述与分析方法的选择181

第十三章　文章实例分析187

第一节　“Exposure to Benzene,Occupational Stress,and Reduced Birth Weight”文章分析187

第二节　“Genetic Susceptibility to Benzene and Shortened Gestation:Evidence of Gene-Environment Interaction”文章分析193

第三节 “A Candidate Gene Association Study on Preterm Delivery:Application ofHigh-throughput Genotyping Technology and Advanced Statistical Methods”文章分析198

第四节 “Maternal Cigarette Smoking,Metabolic Gene Polymorphism,and Infant Birth Weight”文章分析205

第五节 “Polymorphisms of the Paraoxonase Gene and Risk of Preterm Delivery”文章分析216

第六节 “Preconception Homocysteine and B-vitamin Status and Birth Outcomes in Chinese Women”文章分析221

第七节 “Low Preconception Body Mass Index is Associated with Birth Outcome in a Prospective Cohort of Chinese Women”文章分析229

第八节 “Prospective Study of Exposure to Environmental Tobacco Smoke and Dysmenorrhea”文章分析235

第九节　“Tofu Consumption and Blood Lead Levels in Young Chinese Adults”文章分析242

主要参考书目249